El(La) Candidato(a) deberá defender su Tesis en un acto privado, que consistirá en la exposición y defensa de la Tesis de Grado frente a su Comisión Evaluadora de Tesis. Será condición para realizar esta Defensa, que el(la) Candidato(a) demuestre su participación como primer(a) autor(a) de, al menos, una publicación científica en una revista indizada en Web of Science, elaborada durante su permanencia en el Programa.

Luego de recibidos en conformidad los documentos, el Comité dispondrá de un plazo de 10 días hábiles para conformarla Comisión evaluadora de Tesis (integrada por al menos cuatro miembros: tres del Claustro, pertenecientes a cada una de las Instituciones que participan en el Programa, y al menos, un miembro externo a las Instituciones responsables del Programa) y distribuir el documento de tesis para su evaluación. Luego de constituida la Comisión, el Comité fijará la fecha del examen privado en los siguientes 10 días hábiles, e informará a la Dirección General del Programa.

En el caso que el(la) candidato(a) reprobase la defensa privada de tesis, podrá repetir sólo una vez esta actividad en un período no mayor de tres meses desde su reprobación. La CT levantará un acta del examen en la que se consignará la calificación de la actividad y los fundamentos de esta, notificándose al Candidato(a) y a su profesor(a) director(a) de tesis el resultado de su defensa privada. El(La) director(a) de tesis del candidato(a) deberá enviar a la secretaría del programa con, al menos, 10 días hábiles de antelación a la defensa de tesis, el documento de tesis para ser evaluado por la CT.

Una vez aprobada la defensa privada de Tesis, el(la) Candidato(a) deberá realizar un examen público de tesis, en un plazo no mayor a dos meses desde la aprobación unánime de la defensa privada y será calificado con nota conceptual, aprobado o reprobado. Para obtener el grado de doctor(a), el estudiante deberá haber rendido y aprobado lo siguiente:
Asignaturas obligatorias (seis); Asignaturas electivas (seis): Talleres (tres; Examen de calificación; Proyecto de tesis; Avance de tesis (dos); Tesis (Defensa privada de tesis) y Defensa Pública de Tesis

La calificación final de aprobación del grado doctoral se calculará mediante la sumatoria de las calificaciones finales de cada actividad académica con calificación multiplicada por su SCT correspondiente, la cual se dividirá por el número total de SCT aprobados en el Programa. La calificación final de aprobación se describirá en los siguientes conceptos, de acuerdo a las siguientes escalas: Aprobado por Unanimidad: 4,0 a 4,9 Aprobado con Distinción: 5,0 a 5,9 Aprobado con Distinción Máxima: 6,0 a 7,0

El grado de Doctor(a) en Acuicultura será otorgado en forma por las tres Universidades componentes del consorcio.

El diploma será único, hará mención específica a su obtención a través de esta modalidad conjunta, y será suscrito por las autoridades competentes de las tres Instituciones.